Vad att veta
- En FNA-fil är en DNA- och proteinsekvensjusteringsfil i FASTA-format.
- Öppna en med Geneious.
- Konvertera till FASTA och liknande format med samma program.
Den här artikeln förklarar vad en FNA-fil är, hur man öppnar en och hur man sparar en i ett annat format som FASTA, GB, VCF, bilder, etc.
Vad är en FNA-fil?
En fil med filändelsen FNA är en DNA- och proteinsekvensjusteringsfil i FASTA-format som lagrar DNA-information som kan användas av molekylärbiologiprogram.
FNA-filer kan specifikt användas för att bara innehålla nukleinsyrainformation medan andra FASTA-format innehåller annan DNA-relaterad information, såsom de med FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET eller AA filtillägg.
Dessa textbaserade FASTA-format uppstod ursprungligen ur ett mjukvarupaket med samma namn, men används nu som standard i applikationer för DNA- och proteinsekvensanpassning.
FNA hänvisar också till vissa tekniska termer som inte har något att göra med det här filformatet, som slutgiltig nätverksacceptans, möjlighet att utöka filnamn/attribut, Fujitsu nätverksarkitektur och snabb grannannonsering.
Hur man öppnar en FNA-fil
Öppna en i Windows, macOS och Linux med Geneious (det är gratis i 14 dagar). För att göra detta, navigera till File > Import-menyn och välj att importera filen via From Filemeny alternativ.
Du kanske också kan öppna en med BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Testa Notepad++ eller en annan textredigerare om dessa idéer inte fungerar. Filen kan verkligen vara textbaserad och enkel att läsa, eller så kanske du upptäcker att den inte har något att göra med FASTA-formatet, i vilket fall att öppna filen som ett textdokument kan avslöja text som identifierar vad som användes för att skapa filen eller vilket format filen har.
Hur man konverterar en FNA-fil
Vi kan inte verifiera detta eftersom vi inte har provat det, men du bör kunna använda Geneious för att konvertera filen till många andra format, som FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV och VCF. Detta kan göras via programmets File > Export meny.
Samma program bör också kunna spara filen till PNG, JPG, EPS eller PDF, via File > Spara som bildfil.
Även om du norm alt inte bara kan byta namn på en fils filtillägg till något annat och förvänta dig att den ska fungera på samma sätt, kan du byta namn på en. FNA-fil till en. FA-fil om din DNA-sekvenseringsprogram bara känner igen FA-formatet.
Istället för att byta namn på filtillägg, vill du använda en gratis filkonverterare för att konvertera andra filtyper. I fallet med FNA- och FA-filer råkar det bara vara så att vissa program bara öppnar filer som har FA filtillägget, i vilket fall att byta namn på den bör fungera bra.
Kan du fortfarande inte öppna den?
Om du fortfarande inte kan få din fil att öppna efter att ha använt programmen från ovan, kanske du upptäcker att filtillägget faktiskt inte läser. FNA utan istället något som bara ser likadant ut.
Till exempel, FNG-filer (Font Navigator Group) ser väldigt mycket ut som de säger ". FNA", men om du tittar noga är bara de två första bokstäverna desamma. Eftersom filtilläggen är olika, är det en indikation på att de har ett annat filformat och troligen inte kommer att fungera med samma program.
Detsamma kan sägas för många andra filtillägg som FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) och FND (Windows Saved Search).
Tanken här är att bara se till att filtillägget läser. FNA. Om den gör det, försök igen att använda programmen från ovan för att öppna eller konvertera den. Om du har en annan typ av fil, sök efter filtillägget för att ta reda på vilka program som behövs för att öppna eller konvertera den.
FAQ
Hur öppnar man en FNA-fil i Python?
Konvertera först FNA-filen till FASTA-format med ett tredjepartsprogram som Geneious. Sedan kan du ladda ner Biopython, en uppsättning fritt tillgängliga verktyg för biologisk beräkning för arbete inom bioinformatik. Slutligen, se Biopython Tutorial och Cookbook för instruktioner om hur du arbetar med FASTA-filer.
Hur hittar jag mina FNA-tillverkares nummer på en Ancestry-råfil?
Du kan ladda ner de flesta DNA-data från Ancestry.com i.txt-format. Det är dock bara kunder vars DNA analyserades med nästa generations sekvensering (NGS) som har möjlighet att ladda ner en VCF-fil. För att ladda ner en VCF-fil måste du vara DNA-ägaren, ha DNA-testad med NGS-teknik och ha minst 350 MB tillgängligt utrymme på din enhet.
